シソの種は好光性種子といって、発芽時に光を必要としますので、種を深く埋めてしまうと芽が出にくくなります。播種した後は土は薄くかけるだけでよいでしょう。

肥料が切れていると思われます。１株当たり５g程度のパラっと有機元気野菜を株元にまいてあげましょう。

播種が早かったのかもしれません。苗の時に低温に当たってしまうと抽だいしやすくなります。

原因としては、「肥料不足」が考えられます。即効性の液体肥料を10日に1回の頻度であたえて様子を見ましょう。

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適した時期は5～6月、9～10月です。木質化していない枝を10～15cm程度採取して、下部分の5cm程度の葉を除去します。その後切り口を1時間程度水につけておきます。
ポットやセルトレイなどに、ハーブ用の培養土を入れ、しっかり水で湿らせます。
そこに、5cm程度挿して1～2日に1回程度水やりを行います。1カ月程度で根が生えてきます。

花は新たな枝から咲きます。そのため剪定を行って新しい枝を出させることが重要です。新しい枝が出る前の4月頃に 剪定するのがオススメです。
また、水や肥料のあたえすぎでも花がつきづらくなるようです。液肥の頻度や濃度を下げるとよいでしょう。